Keboncau berasal dari kata Kebon (Kebun), dan Cau
(Pisang), hal ini terjadi disaat Lr. Untung sekaligus lurah pertama mengungkap adanya
tumurunnya Keboncau di sebuah hamparan perkebunan pisang
melalui sebuah sejarah di Desa Keboncau. Hal ini didasari selaku
Lr. Untung untuk meraih kemulyan dengan menggiring Ayub
dari Teluknaga.
Desa Keboncau yang pada mulanya merupakan daerah
pertanian yang menginduk ke Sunda.

lalu sekitar tahun 1980 an karena begitu luasnya Desa Keboncau lalu dimekar menjadi 2 ( dua ) desa yaitu Desa Babakan Asem dan Desa Keboncau ( Desa Babakan Asem adalah pemekaran dari Desa Keboncau )

Desa Keboncau merupakan desa yang secara religius beraneka ragam, secara ekonomi didominasi sektor Pertanian.